Ναι ο Orinoco αντιμετωπίζει μολύνσεις αλλά ευτυχώς οχι πάρα πολλές...Είναι κυρίως μολύνσεις από τις πολεμικές επιχειρήσεις μεταξύ Βενεζουέλας και Κολομβίας οι οποίες βρίσκονται τυπικά τουλάχιστον σε πόλεμο...Ευτυχώς όμως πολύ σπάνια γίνονται συγκρούσεις μεταξύ τους...Ο λόγος που μολύνεται ο Orinoco από αυτές είναι γιατί ένα μέρος του αποτελεί τα σύνορα μεταξύ των δύο αυτών χωρών...Ευτυχώς όμως η επίδραση που ασκουν δεν είναι πολύ σημαντική και δεν απειλεί προς το παρόν τα είδη του.Αυτό που απειλεί κάποια είδη είναι η απομάκρυνση από τα πλωτά ποτάμια των δέντρων που πέφτουν στο ποτάμι αμέσω μόλις πέφτουν...Αυτό ανεπιφύλακτα θα μειώσει τον πληθυσμό των ξυλοφάγων ψαριών λόγω έλλειψης τροφής...